林下培育紅豆杉長生快，并且比在松樹林下育苗可節省運菌根土、扯草、搭蔭棚、抗旱等用工40個及節省蔭棚材料等開支1200元，生長高度比大田育苗高出120%至140%。
除此之外，林下育苗法還能有效解決山區育苗地不足問題。因此，林下育苗法在南方紅豆杉研究開發中，值得推廣。其具體方法如下：
(1)種子采集與催芽：南方紅豆杉種子于10月中、下旬，果實呈深紅色時即可采收，由于其種子屬生理后熟，需要通過一年的濕沙貯藏才能發芽。常采取室外自然濕沙藏層積法處理種子，以提高發芽率。
(2)圃地選擇及整地：選擇郁閉度0.6至0.7的無病蟲害濕地松或馬尾松中成林，坡度較為平緩，土層深厚排水良好的地段，在秋季8至9月份將林內雜草和灌木進行清除，并整理成水平梯面，深挖20厘米至30厘米，在11月份，淺翻細耙。整地時，每畝施入腐熟的基肥40擔至60擔，爾后分廂作床，床高。15厘米至20厘米，寬1.2米，整平廂面后用15厘米寬的木板壓出播種溝，深2厘米，播種溝的距離20厘米。
(3)適時播種：種子經過一年的貯藏，有30%的種子裂口現白時，要及時篩出種子，并放在0.2%的高錳酸鉀溶液消毒10分鐘，再用清水沖洗干凈，晾干明水后均勻地播在溝內，播種后，挖取松林下帶有菌根并過篩的黃壤土，覆蓋種子，厚度以不見種子為度。
(4)播種后，鋪植苔蘚護苗，以保護苗床不受雨水打擊和陽光直射，使幼苗不受日灼傷害及避免因莖、葉被泥埋住而窒息死亡，并且能經常保持土壤疏松，濕潤，減少中耕除草用工。
(5)加強苗木病蟲害防治、中耕除草、施肥等技術措施。通過精細管理，一年生苗木可達12厘米至18厘米，二年生苗可達40至50厘米。 
